Tällä hetkellä on käynnissä kunnostuksen rakennussuunnittelu. Kunnostuksen tavoitteena on parantaa vaelluskalojen nousun ja lisääntymisen edellytyksiä, saada Autiojoki hyvään ekologiseen tilaan, kohentaa jokimaisemaa ja parantaa jokivarren ulkoilureittejä.
Autiojokeen sijoittuu kolme tunnistettua vaellusestettä, jotka joen kunnostuksessa poistetaan. Vaellusesteitä ovat Luonetjärven säännöstelypato, Ala-Myllylammen pato Tikkakoskella sekä Puuppolan voimalaitospato Puuppolassa.
Autiojoen kunnostuksen rakentaminen käynnistyy vuonna 2028. Tuleva kunnostushanke on jatkoa Tourujoen kunnostukselle. Hankkeet muodostavat yhdessä kokonaisuuden, jossa vaelluskaloille avautuu nousuyhteys aina Pohjois-Päijänteeltä Luonetjärveen asti.
Luonetjärvi
- Patorakenteen purkaminen ja korvaaminen koskimaisella kynnysrakenteella
- Joen koskiosuuksien kunnostaminen
- Uusi oleskelupaikka joen rannalle
Ala-Myllylampi
- Patorakenteen purkaminen ja korvaaminen koskimaisella kynnysrakenteella
- Joen koskiosuuksien kunnostaminen
Kalmujoki
- Joen koskiosuuksien kunnostaminen
Survonkoski
- Joen koskiosuuksien kunnostaminen
Puuppola
- Patoaltaan ennallistaminen joeksi
- Betonipadon ja maavallin purkaminen
- Puuppolan voimalaitoksen purkaminen
- Puuppolan kosken alaosan tasanteet ja levennykset

